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全自動柱層析的工作原理是通過位置反饋或壓力反饋來控制電機的正轉或反轉運動來實現柱頭自動升降；通過閥的通斷和氣動隔膜泵來實現膠的充填、回收。此外，層析時可與任何層析系統連接配套使用，以達到柱層析分離純化藥物。 新型的層析柱產品采用工作站和層析柱結合成一個層析柱平臺，實現填料自動充填、填料自動回收、清洗柱管、旋轉分離柱管、拆卸不銹鋼篩網。

手動層析柱的工作原理是采用絲桿驅動上柱頭，使柱頭上升和下降；另外，通過小型旋轉輪作用于柱頭內腔中的驅動杠桿，使得其提升和下降，可促使柱頭外側的密封壓緊環實現密封圈的壓緊和松開，進而實現柱頭的密封和解除密封。 還可以通過柱管上法蘭的旋轉螺釘實現上柱頭的旋進和旋出，旋出時可以直接向柱管加入填料，同時可以清洗上篩網，晾干上篩網。旋進時可以直接旋轉絲桿，驅動上柱頭。 手動層析柱的工作原理是采用絲桿驅動上柱頭，使柱頭上升和下降；另外，通過小型旋轉輪作用于柱頭內腔中的驅動杠桿，使得其提升和下降。

專為生物層析開發，一端可調活塞，通過快速螺紋旋轉可以迅速的對柱進行打開和裝填密封，也能方便的拆卸進行零部件清洗。